Investigación
Genómica y Bioinformática
En la Unidad de Genómica y Bioinformática estudiamos la información genética de virus, animales y plantas para comprender su evolución, desarrollo y adaptación. Integramos técnicas de laboratorio, secuenciación y análisis bioinformático con aplicaciones en salud, producción animal y conservación de la biodiversidad.
Responsable
Líneas de investigación
Abordamos diversas preguntas de las ciencias de la vida y la salud mediante cuatro líneas de investigación: Virómica, evolución y vigilancia viral; EmbrioGenómica, desarrollo embrionario y gametogénesis; AgroGenómica, aplicaciones genómicas para el agro; y BioGenómica, generación de recursos genómicos para la conservación de la biodiversidad eucariota.
Virómica
Exploramos la evolución y la filodinámica viral para optimizar la vigilancia epidemiológica en humanos y animales
Laboratorio de Virología DCB, Laboratorio de Genética Molecular Humana DCB, Departamento de laboratorios de salud publica del Ministerio de Salud Publica DLSP-MSP, Instituto Oswaldo Cruz -Fiocruz Rio de Janeiro Brasil, Universidade Federal do Espirito Santo, Universidad de Córdoba Argentina
EmbrioGenómica
Estudiamos la regulación y activación genómica durante la maduración del ovocito, la fecundación y el desarrollo embrionario preimplantatorio en mamíferos
Laboratorio de Producción in vitro de embriones CENUR Noreste, Facultad de Veterinaria UdelaR, Universidad CES Medellín Colombia
AgroGenómica
Aplicamos herramientas genómicas para la toma de decisiones relevantes para el sector agropecuario.
Laboratorio de Vectores y Enfermedades transmitidas DCB, Investigación y Desarrollo de Moléculas Bioactivas DCB, Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria INIA, Universidad Nacional de Colombia
BioGenómica
Generamos recursos genómicos para conservar la biodiversidad neotropical
Laboratorio de Ecología Fluvial DCB, Laboratorio Biogeografía y Evolución CENUR Noreste, Universidad de Antioquia Medellín Colombia, Red de Genomas Neotropicales Biogenomas, Key Lab of Marine Genomics Shenzhen China
Proyectos
- Biodiversidad, ictioplancton y procesos ecológicos de áreas protegidas fluviales del Uruguay: bases para manejo y conservaciónANII, Fondo Ida Holz · 2026-2030 · Integrante del equipo
- Construcción de recursos genómicos de referencia de alta calidad para peces del género Pseudoplatystoma del río UruguayCSIC Iniciación · 2026-2027 · Responsable
- secuenciar, ensamblar y anotar los genomas de la choca (Chaetostoma brevilabiatum, Loricariidae) y el blanquillo (Sorubim cuspicaudus, Pimelodidae) del MagdalenaISAGEN, Colombia · 2026-2028 · Responsable
- Explorando RNAs pequeños en embriones bovinos producidos in vitro como mediadores de respuesta de desarrollo ante los cambios estacionalesCSIC I+D · 2025-2027 · Co-responsable
- Caracterización molecular de formas recombinantes del Virus de la Inmunodeficiencia Humana Tipo 1 (VIH-1) circulantes en Uruguay.Fondo vaz Ferreira · 2024-2026 · Responsable
Integrantes
Colaboradores
- Dra. Rosa Flieller · Departamento de laboratorios de salud publica del Ministerio de Salud Publica DLSP-MSP (Uruguay)Vigilancia epidemiológica de VIH-1
- Dr. Gonzalo Bello · Instituto Oswaldo Cruz -Fiocruz (Brasil)Filodinámica viral
- Dr. Edson Oliveira de la Torre · Universidade Federal do Espirito Santo (Brasil)Filodinámica viral
- Dr. Rodney Colina · CENUR Litoral Norte UdelaR (Uruguay)Virología molecular
- Dr. Julio da Luz · CENUR Litoral Norte UdelaR (Uruguay)Identificación de variante en exomas humanos
- Dr. Francisco Báez · CENUR Noreste UdelaR (Uruguay)Expresión génica en el desarrollo embrionario
- Dr. Iván González · CENUR Litoral Norte UdelaR (Uruguay)Identifiación molecular de peces
- Dr. Jonny Yepes Blandón · Universidad de Antioquia (Colombia)Generación de recursos genómicos de peces
Enseñanza
Grado
- Genómica. Ciclo en Biología-Bioquímica
- Biología de la Reproducción. Ciclo en Biología-Bioquímica
- Introducción a las Ciencias Biológicas I. Ciclo en Biología-Bioquímica,
- Biología Molecular. Licenciatura en Biotecnología
- Introducción a la Biotecnología. Licenciatura en Biotecnología
Posgrado
- Herramientas Básicas de Genómica y Bioinformática. PEDECIBA
- Evolución Biológica: Enfoque Multidisciplinario. PEDECIBA
- Bioinformática aplicada a análisis celulares y moleculares. Posgrado en Salud Animal
- Biotecnología aplicada: manejo, clasificación y preservación de gametos. Posgrado en Salud Animal
- Estrés calórico en bovinos. Posgrado en Salud Animal
Otras
- Pasantías de 4to año, Profesorado de Biología, CeRP Salto
- Pasantías de último semestre, Tecnologó en Biotecnología de la UTU
Extensión
Medios y divulgación
- En qué nos metimos: ciclo de entrevistas a investigadores del DCB en Radio La Regional
- Podcast Tejiendo Redes, InvestigaUY
- Charlas en la Semana de la Ciencia y la Tecnología
Trabajo con centros educativos
- Científica invitada Colegio Salesiano, para certamen del Ministerio de Educación y Cultura (MEC) y la Dirección Nacional de Innovación, Ciencia y Tecnología (DICYT).
- Científica invitada Liceo N.º 6 de Salto, para certamen del Ministerio de Educación y Cultura (MEC) y la Dirección Nacional de Innovación, Ciencia y Tecnología (DICYT).
Ferias, congresos y jornadas
- Jornada Universidad de Puertas abiertas
- Comité organizador del encuentro de Agrogenómica
Publicaciones recientes
- Reyes-Ábalos AL, Barcelona B, Rodríguez-Osorio N, Báez F. Stage-dependent ultrastructural remodeling of the zona pellucida of in vitro-produced bovine embryos. Theriogenology. 2026;266:118146. doi:10.1016/j.theriogenology.2026.118146
- Yepes-Blandón J, Almansa-Villa D, Benítez-Galeano MJ, Mir D, Hernández-Rangel J, Atencio-García V, et al. Clarifying species boundaries between bocachico (prochilodus magdalenae) and bocachico de maracaibo (prochilodus reticulatus) (Characiformes: prochilodontidae) using complete mitochondrial genomes. Frontiers in Genetics. 2025;16. doi:10.3389/fgene.2025.1661527
- Alfaro JM, Vasquez EM, Rodriguez-Osorio N, Urrego R. Identification of new DNA methylation markers associated with obesity in children. Obesity Research & Clinical Practice. 2025;19(5):448-50. doi:10.1016/j.orcp.2025.09.003
- Kalbfleisch TS, McKay SD, Murdoch BM, Adelson DL, Almansa-Villa D, Becker G, et al. The ruminant telomere-to-telomere (RT2T) consortium. Nature Genetics. 2024;56(8):1566-73. doi:10.1038/s41588-024-01835-2
- Báez F, de Brun V, Rodríguez‐Osorio N, Viñoles C. Low oxygen tension during in vitro embryo production improves the yield, quality, and cryotolerance of bovine blastocysts. Animal Science Journal. 2024;95(1). doi:10.1111/asj.13941
- Yepes-Blandón JA, Bian C, Benítez-Galeano MJ, Aristizabal-Regino JL, Estrada-Posada AL, Mir D, et al. Draft genome assembly for the Colombian freshwater bocachico fish, prochilodus magdalenae. Frontiers in Genetics. 2023;13. doi:10.3389/fgene.2022.989788
- Ramirez-Nieto G, Mir D, Almansa-Villa D, Cordoba-Argotti G, Beltran-Leon M, Rodriguez-Osorio N, et al. New insights into avian infectious bronchitis virus in Colombia from whole-genome analysis. Viruses. 2022;14(11):2562. doi:10.3390/v14112562
- Báez F, López Darriulat R, Rodríguez-Osorio N, Viñoles C. Effect of season on germinal vesicle stage, quality, and subsequent in vitro developmental competence in bovine cumulus-oocyte complexes. Journal of Thermal Biology. 2022;103:103171. doi:10.1016/j.jtherbio.2021.103171
- Mir D, Rego N, Resende PC, Tort F, Fernández-Calero T, Noya V, et al. Recurrent dissemination of SARS-CoV-2 through the Uruguayan–Brazilian border. Frontiers in Microbiology. 2021;12. doi:10.3389/fmicb.2021.653986
- Delatorre E, Mir D, Gräf T, Bello G. Tracking the onset date of the community spread of SARS-CoV-2 in western countries. Memórias do Instituto Oswaldo Cruz. 2020;115. doi:10.1590/0074-02760200183